Dan prije smrti, 23. novembra, objelodanio je javnosti da je zaražen HIV-om, što je bila njegova dugo čuvana tajna koju je znala njegova prijateljica Meri Ostin (74). Sa njom je Fredi imao poseban odnos. Bili su pet godina u vezi početkom sedamdesetih, a onda joj je priznao da je gej. Nakon toga njihova ljubav je bila samo platonska, ali i dalje veoma čvrsta.

Ostala je uz njega i bila mu podrška u svemu. U posljednjim danima donio je važnu odluku i tajnu koju će Meri, po svemu sudeći, ponijeti sa sobom u grob – nije želio da otkrije gdje je njegova urna sa pepelom. Ugovorom ju je obavezao da nikada ne otkrije šta je učinila s urnom.

Meri je ispoštovala dogovor i Fredija nikada nije izdala. Čuvala je sve njegove tajne, pa tako i ovu – o kojoj ćuti već 34 godine. Ni Fredijevim roditeljima nije rekla gdje se nalazi njegova urna. Merkjuri joj je ostavio imanje u Londonu i oko devet miliona funti gotovine. Danas živi u stanu koji je naslijedila od njega.

Fredi je pred smrt bio u vezi sa frizerom Džimom Hatonom, koji je preminuo 2010. godine u 60. godini. Vezu su započeli 1985. i bio je s njim do posljednjeg trenutka. Ipak, bogatstvo je ostavio Meri i upozorio je da će kuća biti veliki izazov, iako ona toga tada još nije bila svjesna. Kada je Merkjuri preminuo, Meri je imala zdravstvenih problema i vodila je sudske procese u vezi sa nasljedstvom koje joj je ostavio.

„Mislila sam: ‘O, Fredi, ostavio si mi toliko mnogo, i toliko mnogo tereta.’ Mislila sam da ne mogu da se nosim s tim. Upozorio me da će kuća biti veći izazov nego što sam svesna. Zahvalna sam mu što me upozorio, jer sam se brzo suočila s velikom ljubomorom“, rekla je svojevremeno Meri.

Biograf grupe Kvin jednom prilikom je rekao za Meri da je bila uz Fredija prije svega i posle svega. Njegova bolest bila je tajna, a ona mu je odmah na početku obećala da nikome neće reći – da to može učiniti jedino on, i to kada on to bude želio.